本书全面系统地介绍了进化算法在生物多序列比对中的应用，根据内容的分类，分为“多序列比对基础篇”“多序列比对模拟篇”和“多序列比对参数篇”三个模块。首先介绍生物多序列比对的基础知识，包括多序列比对的基本概念、原理、方法、常用数据库、常用工具和应用等内容，并介绍进化算法和最优化理论的基础知识，以及遗传算法、粒子群优化算法和量子粒子群优化算法的优化过程及收敛性分析，为进行多序列比对的模拟提供理论基础;然后详细介绍各进化算法模拟多序列比对的过程与结果: 最后对于多序列比对最重要的目标函数参数进行建模与分析。本书具有系统性强、可读性强、可操作性强等特点。